農村鄉鎮污水處理存在的問題：排水系統不足：我國大多數鄉鎮沒有系統規劃，供水設施不完善，污水收集管網不完善或不完善。雨水、污水沿道路邊溝或道路就近排到水體，呈無組織排放狀態，造成污水收集困難。由于街道狹窄、兩側建筑密集、建設復雜、受當地經濟條件制約，一些鄉鎮無條件地建設了排水系統。 國內廢水處理工藝主要有超磁分離工藝、機械加速澄清池、高密度傾斜板沉淀池處理工藝。面對煤礦廢水排放量大及修建廢水池的需要，近年來出現了微濾處理工藝，主要是考慮占地制約及原廠擴建等限制因素。表1是幾種處理工藝的對比。與以往對廢水加工的添加化學制劑不同的是，在國際上出現一種生物化學處理法，其處理原理是菌化過程改變井水中的金屬物質。其主要做法就是在酸性條件下將氧化亞鐵硫桿菌投入到廢水內，完成對其酸性礦井水的中和及除去Fe的過程。此外還有一種利用自然生態系統中的濕地進行廢水處理，通過對廢水中的雜質的吸附過濾和離子交換以達到污水的高效凈化。以上兩種方法具有廢水處理費用成低、耐沖擊和滿足間歇排放污水的特點。對于污水的處理可以采用這兩種手段，并把這兩種技術引用到實際污水處理過程中。

農村鄉鎮污水處理存在的問題：缺乏適當的處理程序：一般鄉鎮經濟基礎薄弱，污水處理工程建設資金匱乏。缺乏適合鄉鎮污水特點的實用處理工藝，大部分是大中型城市污水處理工藝和設計參數的推廣或照搬，造成項目投資和運行費用較高。

農村鄉鎮污水處理存在的問題：缺乏施工標準：目前，我國尚無鄉鎮污水處理工程的排水設計標準、規范和規程。目前城市污水處理工程的設計和施工仍采用現行的有關標準和規范，造成鄉鎮污水處理工程的建設和運營成本過高。此外，鄉鎮污水處理工程的設計和施工完全適用現行的設計標準和規范，顯然不適用。