風冷臭氧發生器是利用風扇來冷卻臭氧機產生的熱量，適用于小型的空間消毒，小型水冷臭氧發生器的話是利用自來水來冷卻機器的熱量，一般用在水處理和大型車間消毒使用，但是有個局限性就是必須要接水管，比較麻煩。

兩種機器散熱方式不一樣，但都是利用臭氧來消毒的。臭氧發生器一種采用的是水冷散熱，另一種采用的是風冷散熱的方式。一般水冷臭氧發生器的都是運用在大型的臭氧發生器，用于水處理、純凈水消毒殺菌、GMP車間居多，風冷臭氧發生器多數是小型到中型的臭氧發生器，用在車間消毒，空間消毒殺菌。

風冷臭氧發生器還是水冷臭氧發生器，區別首先在就在于兩者的性價比上，水冷臭氧發生器的零部件會比風冷臭氧發生器的要好，所以其價格跟風冷臭氧發生器的是不一樣。